Sertânia relata os delírios de Antão (Vertin Moura), um jagunço que faz parte do bando do cangaceiro Jesuíno (Julio Adrião). Quando bandidos tomam a cidade de Sertânia, Antão é ferido, preso e deixado para morrer. Rastejando pela caatinga, baleado, delirando e recordando de forma confusa os acontecimentos que precedem o atual momento, durante o filme são apresentadas imagens que se contradizem provenientes dos delírios de Antão, como o possível assassinato de Jesuíno por suas mãos, referências religiosas como a Santa Ceia e imagens do presente e da produção do filme. Com referências ao movimento cinematográfico do Cinema Novo e Glauber Rocha, o filme também apresenta discussões raciais e da miséria nordestina, comum no inicio do século passado.